Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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