Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm20828J3KMI7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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