Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf4bG5E8Z2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms