Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef1G3X9K3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms