Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28038F7BCN9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm28038F7BCN9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm28038F7BCN9 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm28038F7BCN9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm28038F7BCN9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm28038F7BCN9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Gm28038F7BCN9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Gm28038F7BCN9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Gm28038F7BCN9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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