Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atf6F6VAN0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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