Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Taf4E9QAP7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Taf4E9QAP7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4E9QAP7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4E9QAP7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms