Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod3E9QA62 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms