Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms