Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

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Length 1,068 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Krt78E9Q0F0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt78E9Q0F0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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