Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms