Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms