Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms