Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms