Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Samd1D3YXK1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Samd1D3YXK1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Samd1D3YXK1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms