Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms