Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Phf11bB4XVQ1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Phf11bB4XVQ1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Phf11bB4XVQ1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Phf11bB4XVQ1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Phf11bB4XVQ1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Phf11bB4XVQ1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Phf11bB4XVQ1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Phf11bB4XVQ1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Phf11bB4XVQ1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms