Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap58B2RW38 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms