Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apba1B2RUJ5 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms