Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms