Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2al1jA2BFR3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms