Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms