Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms