Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms