Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms