Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms