Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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