Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms