Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms