Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hdac6Q9Z2V5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac6Q9Z2V5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac6Q9Z2V5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac6Q9Z2V5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac6Q9Z2V5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac6Q9Z2V5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hdac6Q9Z2V5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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