Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms