Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms