Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms