Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms