Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms