Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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