Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms