Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms