Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms