Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms