Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms