Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms