Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cml5Q9QXS8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms