Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdcQ9QW08 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms