Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc2lQ9JME7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms