Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms