Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Crlf1Q9JM58 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Crlf1Q9JM58 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms