Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Tgm1Q9JLF6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Tgm1Q9JLF6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Tgm1Q9JLF6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Tgm1Q9JLF6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Tgm1Q9JLF6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Tgm1Q9JLF6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Tgm1Q9JLF6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Tgm1Q9JLF6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Tgm1Q9JLF6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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