Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nectin3Q9JLB9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nectin3Q9JLB9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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