Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms